宇宙世紀0091年、木星圏で暮らすジュドー・アーシタの元に、アムロ・レイが訪れる。アムロはジオン残党が関わる謎の超巨大モビルスーツの調査を依頼。二人はメガゼータに乗り込み強行偵察へ向かう。小惑星の陰に隠された「伝説巨神」を発見した彼らは、その内部へ潜入する。そこでジュドーは助けを求める声に導かれ、サイコミュ装置に囚われたミネバ・ザビを見つけるのだった。ガンダムとイデオンという二つの巨編が交錯する、壮大なスケールのクロスオーバー作品。もしもの歴史を描く、骨太なSFロボットドラマだ。
