惑星Ziには、金属生命体ゾイドと人間が共存する世界が広がっている。一流のゾイド乗りだった父に憧れる少年バン・フライハイトは、相棒となるゾイドを求め砂漠の遺跡へ。そこで彼は、白銀の恐竜型ゾイド・ジークと、記憶を失った謎の少女フィーネと出会うのだ。ゾイドを憎む少年レイヴンとその相棒シャドーの襲撃を受け、ジークに秘められた力に目覚めたバンは、フィーネと共に壮大な冒険の旅へと出発する。仲間たちとの出会いを経て、ゾイドイヴを巡る戦いに巻き込まれていく彼らの成長と熱いゾイドバトルが胸を熱くする本格メカアクションだ。
